Há duas alternativas.
A primeira é o contador do cliente solicitar para a SEFAZ do estado uma autorização para estender o prazo de cancelamento (e, aí, cada estado pode ter regras próprias).
Veja mais em: https://blog.oobj.com.br/cancelamento-nfce/
A outra possibilidade é fazer uma devolução no GigaERP. Lá no gerenciador de notas fiscais, ao tentar cancelar uma NFC-e cujo prazo tenha expirado, o sistema direciona para tela de devolução de vendas, já preenchendo alguns campos. Ao finalizar é importante informar no campo "Ação" a opção: Devolver.